太阳能热水器中所用为一般自来水，水中含有NaCl ,MgCl2 ，CaCl2等矿物质，另外还有CO2，O2等可溶解性气体，以及NaClO消毒剂成分，各个地区自来水中成分含量不一样，但是经过加热、降温再循环加热使用的过程，会使自来水中部分不溶解物质析出形成水垢，水垢的密度远高于水，久而久之，就导致了水箱和真空管内壁中水垢的形成，并附着于内壁上，形成了水垢。
淋浴喷头的孔很细，水垢堵塞淋浴喷头，热水器就不能正常供应出热水。水垢中含有多种化学成分,长期的沉淀和积累使水中的有害物质不断增加,可能导致皮肤过敏。水垢附着在内胆的表面，造成垢下腐蚀，造成漏水，破坏保温效果，减少太阳能热水器的使用寿命。
水垢影响水温仪及电加热系统的正常使用，导致集热管吸收的热量不能及时传递给水，垢壳在水流的冲击下产生脱落，造成真空管内水循环不畅乃至堵塞。传感器结有水垢会造成传感器失灵，导致水温、水位显示不准确，电加热设备干烧损坏或局部温度过高，导致设备损坏,容易炸管。
太阳能热水器除垢须知：
①最好选择前一天晚上用完热水器中的水，次日早上进行清洗，不会导致真空管的大量受热；
②除垢剂最好选用稀盐酸性质液体进行除垢；
③清洗过程中注意带上手套，防止真空管突然碎裂划伤手或者烫伤；
④清洗完成后进行系统试水，确保无问题后清洗工作结束。
建议：一般太阳能热水器用1年，需要清洗水垢了，之后大概可以每三个月清理一次。
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